LabDAO 正在描繪用於藥物發現的開源 AI 的未來

Folding@home 項目在整個 COVID-19 大流行期間成為頭條新聞,用於整理未使用的計算能力來探索蛋白質折疊搜索空間以應對新型冠狀病毒。 該計劃旨在讓公民憑藉自己的能力成為科學家,在全球“註冊”計算機的分佈式網絡中對蛋白質的不同分子結構進行大規模模擬。

這種去中心化範式因將人們聚集在一起圍繞一個共同問題和有效地眾包計算能力而受到歡迎,但如果計算能力和解決問題的基礎設施被顛倒呢? 換句話說,如果個人可以通過利用積累的計算能力來運行自己的項目會怎樣? 啟動生物實驗的工具?

LabDAO 正在通過其 PLEX 平台讓這個夢想成為現實。 PLEX 是一種開源命令行工具,旨在使計算資源和各種生物機器學習工具(在 LabDAO 中創造的“BioML”套件)可在各種背景下訪問。 無論是試驗小分子對接還是自己進行蛋白質折疊模擬,PLEX 都允許用戶利用 LabDAO 的工具庫、共享結果並在不到五分鐘的時間內將其可視化。

這套工具及其之上的使用支持平台於 XNUMX 月初在 Zuzalu 的區塊鏈與生物學峰會上展出,LabDAO 核心團隊成員 Lily Hansen-Gillis 從頭到尾展示了一個內部分子動力學的模擬蛋白質以找到其最穩定的構型。 然後,作為一名自稱“非編碼員”的人,她帶領觀眾從頭到尾完成了整個過程——所有這些都使用了計算機、WiFi、命令行上的 PLEX,僅此而已。

更廣泛地說,LabDAO 是一個支持 web3 的去中心化平台(更大的“DeSci”運動的一部分)致力於為開源驅動的藥物發現創造一個更高效的環境。 通過為更廣泛的生態系統提供最前沿的工具和資源,LabDAO 旨在為透明和可訪問的科學進步創造合適的環境。 無論是通過消除研究人員擁有自己的硬件或計算基礎設施的需要,還是在區塊鏈分類賬上發布實驗結果以使其易於處理和重現,該組織都致力於通過合作實現更多創新——打破由貧困造成的障礙可用性和孤立的利基專業知識。

LabDAO 為今天構建這個未來的 DeSci 世界所做的努力最近得到了來自其他各種 DAO、Inflection.xyz、Balaji Srinivasan 等的 3.6 萬美元一輪融資的推動。 這種支持的湧入將有助於持續努力構建開源軟件工具並加強 LabDAO 的研究生態系統。

至於 PLEX 本身,即將開始的下一步包括在不同的科學合作中測試平台、容器化各種工具,以及積累必要的硬件來培育 BioML 網絡。

至於長期,也許下一次重大傳染病爆發期間的下一種救命藥物將利用 PLEX 的力量設計,一次一個去中心化的進步。 隨著生態系統的不斷發展,只有時間才能證明一切。

謝謝至 艾莎妮·阿特雷什 有關本文的更多研究和報告。 我是 SynBioBeta 的創始人,我寫的一些公司是讚助商 SynBioBeta會議. 更多內容,您可以訂閱 我的每週時事通訊.

來源:https://www.forbes.com/sites/johncumbers/2023/06/02/labdao-is-charting-the-future-of-open-source-ai-for-drug-discovery/